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データベース Integrative Disease Omics Database (iDOx DB)

現在のopen access data

  • 下記の表にリンクのあるデータを表として閲覧できます。単純な並べ替えや検索はできますが、このサイトからのダウンロード等はできません。

    なお、△は公開予定。-は解析対象外のデータです。

  • 表として閲覧(open access)できるデータ以外のデータについては、共同研究等の枠組みでの提供(共有)が可能な場合があります。具体的には、「対象疾患」のタブの連絡先までご相談ください。

DiseaseClinical InfoGenomeEpigenomeTranscriptomeProteomeMetabolome
SNP ArrayWES1)CNA2)mtDNA3)MethylationWTS4)Fusion GenemRNA ArraymiRNA ArrayIonLipid

てんかん

Epilepsy

O - - - - 群別
個別
- - 群別
個別
群別
個別
群別 群別
個別
群別
個別

肺がん

Lung Cancer

O 個別 SNV
INDEL
ASCAT
GPHMM
- 群別 FPKM deFuse
TopHat
群別
個別
群別
個別
群別 - -

腎がん

Kidney Cancer

O 個別 SNV
INDEL
- - 群別 - deFuse
TopHat
群別 群別 群別 群別 群別

乳がん

Breast Cancer

O 個別 SNV
INDEL
ASCAT
GPHMM
- 群別 FPKM deFuse
TopHat
- - 群別 - -

胃がん

Gastric Cancer

O 個別 SNV
INDEL
ASCAT
GPHMM
- 群別 FPKM deFuse
TopHat
- - - - -

肥満症

Adiposity

O - - - - 群別 - - 群別
個別
群別 群別 群別 群別

非アルコール性脂肪性肝炎

NASH:
Non-alcoholic Steatohepatitis

O - - - - 群別 - - 群別 群別 群別 - 群別

拡張型心筋症

Dilated Cardiomyopathy

O - - - 群別
個別
群別 - - 群別 群別 群別 - 群別

大動脈瘤

Aortic Aneurysm

O - - - 群別
個別
群別 - - 群別 群別 群別 群別 群別

アレルギー性疾患

Allergic Disease

O - - - - 群別 - - 群別 群別 群別 群別
個別
群別
個別

小児白血病

Childhood Leukemia

O 個別 SNV
INDEL
- - 群別 FPKM - 群別 群別 群別 - 群別

アルツハイマー病

Alzheimer's Disease

O - - - - - - - - 群別 群別 - -

脊柱管狭窄症

Spinal Canal Stenosis

O - - - - 群別 - - 群別 - 群別 群別 群別

※Abbreviations:

  1. WES: Whole Exome Sequencing
  2. CNA: Copy Number Abnormality
  3. mt DNA: mitochondrial DNA
  4. WTS: Whole Transcriptome Sequencing, RNA sequencing